肺炎13价疫苗的副作用相对较轻微，大多数人接种后不会出现严重问题。一般来说，常见的副作用发生率较低，比如接种部位可能出现红肿、疼痛，这种情况通常在1-2天内会自行缓解，发生率大约在10%-30%左右。
接种部位的副作用
局部红肿：接种后少数人接种部位会出现红肿，一般红肿范围比较小，直径多在2-5厘米左右，大多不需要特殊处理，保持局部清洁干燥，避免搔抓，通常1-3天可消退。局部疼痛：接种处可能有疼痛感，一般为轻度或中度疼痛，多数人可以耐受，疼痛一般会在2-3天内消失。
全身的一般副作用
发热：部分接种者可能出现发热，多为低热，体温一般在37.5-38.5℃之间，这种发热情况通常持续1-2天就会自行消退。不过也有少数人可能出现中热，体温在38.5-39℃，但持续时间也较短，很少超过3天。乏力：接种后个别人会感觉身体乏力，没有精神，这种乏力感一般比较轻微，经过适当休息，1-2天就能恢复。
罕见但需关注的副作用
过敏反应：虽然发生概率很低，但也有可能出现过敏，比如皮肤出现皮疹，严重的可能出现荨麻疹、血管神经性水肿等。如果出现皮疹且伴有瘙痒加重、呼吸困难等情况，需要及时就医处理。胃肠道反应：少数人可能出现胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹泻等。一般症状较轻，通过调整饮食，注意休息，症状会逐渐缓解。如果症状持续不缓解或加重，也需要就医咨询。