牙周炎的治疗药物主要包括抗菌药物等。一般来说，甲硝唑是常用的抗厌氧菌药物，可用于牙周炎的辅助治疗。
抗菌药物类
甲硝唑： 属于硝基咪唑类药物，对厌氧菌有较好的抑制作用，能帮助控制牙周炎患者口腔内的厌氧菌感染，但使用时需注意孕妇及哺乳期妇女禁用等情况。阿莫西林： 是广谱青霉素类抗生素，可与甲硝唑联合使用，增强抗菌效果，不过对青霉素过敏者禁用。
局部用药类
米诺环素凝胶： 这是一种局部使用的四环素类药物，直接作用于牙周袋内，能持续释放药物，抑制细菌生长，局部使用相对全身用药副作用较小，但少数人可能会出现局部刺激症状。碘甘油： 具有杀菌、收敛、消炎的作用，可用于牙周袋的局部涂抹，缓解炎症，但使用时要避免接触眼睛等敏感部位。
非甾体抗炎药类
布洛芬： 具有抗炎、镇痛、解热的作用，当牙周炎引起疼痛时，可短期服用来缓解疼痛症状，但有消化道溃疡病史者等需慎用。阿司匹林： 也有一定的抗炎镇痛作用，但长期或大量使用可能会引起胃肠道不适等不良反应，使用时需遵循医嘱。牙周炎的药物治疗只是综合治疗的一部分，还需要配合牙周基础治疗，如洁治、刮治等。同时，不同患者的病情不同，药物的选择和使用应在医生的指导下进行，医生会根据患者的具体情况制定个性化的治疗方案。