毛囊炎主要是由细菌等病原体感染引起的。比如金黄色葡萄球菌就常是引发毛囊炎的常见病菌，大约60% - 70%的毛囊炎是由金黄色葡萄球菌感染导致的。
病菌感染引发
细菌感染： 最常见的是金黄色葡萄球菌，它容易在皮肤有破损、油脂分泌过多等情况下侵入毛囊，引发炎症。像头皮油脂分泌旺盛的人，就更易被金黄色葡萄球菌盯上，从而出现头皮毛囊炎。还有表皮葡萄球菌，也可能导致毛囊炎，它相对金黄色葡萄球菌致病力稍弱，但也会引起皮肤局部的炎症反应。真菌感染： 马拉色菌是常见的真菌病原体，当皮肤油脂分泌过多时，马拉色菌会大量繁殖，进而侵犯毛囊引发毛囊炎。比如一些油性皮肤的人，在高温潮湿环境下，马拉色菌容易滋生，就容易患上马拉色菌性毛囊炎。
皮肤卫生状况不佳
清洁不到位： 长时间不洗澡，皮肤表面的污垢、油脂、死皮等会堆积，容易堵塞毛囊，为细菌、真菌等病原体滋生创造条件，增加毛囊炎的发病风险。例如，一个星期不洗澡的人，皮肤表面的脏东西积累多，毛囊被堵后就更易长毛囊炎。多汗： 出汗较多时，汗液会使皮肤处于潮湿环境，利于细菌繁殖。像爱运动的人，运动后大量出汗，如果不能及时清洁皮肤，就容易引发毛囊炎。比如打篮球后满身大汗，若没及时洗澡换衣，就可能在背部、颈部等部位长出毛囊炎。
机体自身因素影响
免疫力低下： 当人体免疫力降低时，比如患有糖尿病、艾滋病等疾病，或者长期使用免疫抑制剂的人，身体抵御病原体的能力下降，就更容易受到细菌、真菌等的侵袭，从而引发毛囊炎。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体抵抗力差，比普通人患毛囊炎的几率要高2 - 3倍。毛发状态异常： 毛发过度牵拉、摩擦等也可能引发毛囊炎。比如经常扎很紧的马尾辫的人，头发长时间受到牵拉，毛囊周围的皮肤容易受损，细菌就容易侵入，导致头皮毛囊炎。还有刮胡子时不小心刮伤皮肤，也可能引发毛囊炎，因为刮伤的皮肤给了细菌可乘之机。