霉菌性阴炎主要是由白色念珠菌等真菌感染引起，约10%～20%的非孕女性及30%的孕妇阴道中有此菌寄生，但菌量少不引起症状，当全身及阴道局部免疫能力下降时，白色念珠菌大量繁殖就会引发炎症。
自身菌群失调因素
阴道内环境变化： 正常情况下，阴道内有多种微生物平衡存在，其中乳酸杆菌占优势。当长期应用广谱抗生素时，会抑制乳酸杆菌生长，破坏阴道内的微生态平衡，从而有利于白色念珠菌大量繁殖。比如，连续使用广谱抗生素超过1周，就可能增加霉菌性阴炎的发病风险。免疫力低下时期： 当人体免疫力下降时，比如患有糖尿病，血糖控制不佳时，阴道内糖原含量增高，酸度增加，也为白色念珠菌的生长繁殖创造了有利条件。据统计，约60%的糖尿病患者容易反复发作霉菌性阴炎。
局部卫生不良因素
不注意外阴清洁： 不经常清洗外阴，不勤换内裤，会导致外阴局部潮湿，给白色念珠菌的滋生提供温床。比如，长时间不更换内裤，分泌物残留就容易引发感染。过度清洗阴道： 有些女性过度讲究卫生，频繁用洗液冲洗阴道，这样会破坏阴道内正常的酸性环境，影响乳酸杆菌的生长，进而破坏阴道的自净作用，增加霉菌性阴炎的发生几率。一般建议每周用清水清洗外阴1～2次即可。
外部感染传播因素
接触被污染的物品： 使用公共浴池、浴盆、浴巾、坐便器等被白色念珠菌污染的物品，有可能间接感染霉菌性阴炎。比如，在公共浴室光着脚走路，就可能接触到被污染的地面而感染。性接触传播： 霉菌性阴炎可以通过性接触传播，女方患病后，通过性生活可将白色念珠菌传给男方。不过，男性感染后通常症状不明显，容易成为传染源再次传染给女性。