新生儿重度窒息有可能留下后遗症，其发生概率受多种因素影响，比如窒息的程度、复苏是否及时有效等。一般来说，重度窒息后约有1/3的新生儿可能出现不同程度的后遗症。
一、神经系统后遗症
智力发育迟缓： 重度窒息可能影响新生儿脑部的正常发育，导致智力发育速度比正常新生儿慢。有研究发现，约15% - 25%的重度窒息新生儿在婴幼儿期会出现智力发育迟缓的情况，表现为对周围环境反应迟钝、认知能力落后于同龄儿等。脑瘫： 这是比较严重的神经系统后遗症之一。重度窒息使脑部缺氧缺血，容易造成脑损伤，进而引发脑瘫。大约5% - 10%的重度窒息新生儿会发展为脑瘫，患儿会出现运动功能障碍，如肌肉张力异常、姿势异常、运动发育落后等，严重影响其运动和生活自理能力。
二、呼吸系统后遗症
慢性肺部疾病： 重度窒息可能损伤新生儿的肺部组织，导致慢性肺部疾病。例如支气管肺发育不良，在重度窒息的新生儿中，约有3% - 8%会发生支气管肺发育不良，表现为长期需要吸氧、呼吸功能较差等，影响新生儿的呼吸功能和生长发育。反复呼吸道感染： 由于重度窒息后新生儿的呼吸系统功能受到一定影响，免疫力相对较低，容易出现反复呼吸道感染的情况。据统计，约20% - 30%的重度窒息新生儿在后续成长过程中会比正常新生儿更频繁地发生呼吸道感染，如肺炎等。
三、其他系统后遗症
心血管系统问题： 重度窒息可能对新生儿的心血管系统造成影响，出现心肌损伤等情况。部分新生儿可能会遗留心律失常、心功能不全等问题。大约有2% - 5%的重度窒息新生儿会存在心血管系统的后遗症，影响心脏的正常功能。消化系统问题： 重度窒息后新生儿的消化系统也可能受到影响，出现喂养困难、胃肠功能紊乱等情况。有的新生儿会出现吃奶量少、呕吐、腹胀等问题，长期可能导致营养不良，影响生长发育，约有10% - 15%的重度窒息新生儿存在不同程度的消化系统后遗症。