血小板减少的原因有多种。其中，自身免疫性疾病是常见原因之一，像免疫性血小板减少性紫癜，约占成人原发性血小板减少性紫癜的70% - 80%，是由于自身免疫系统错误地攻击血小板导致其破坏过多。
血液系统疾病导致
再生障碍性贫血： 这是一种骨髓造血功能衰竭症，会使骨髓生成血小板的数量减少。患者除了血小板减少，还常伴有贫血、感染等表现，外周血全血细胞减少。白血病： 白血病细胞在骨髓内大量增殖，抑制了正常造血，包括血小板的生成。例如急性白血病，骨髓中白血病细胞恶性增殖，正常造血受抑，可导致血小板明显减少。
感染因素引起
病毒感染： 某些病毒感染可引发血小板减少，比如风疹病毒、麻疹病毒、EB病毒等感染后，可能会影响骨髓造血功能或导致血小板破坏增加。一般病毒感染控制后，血小板减少情况可能会改善，但也有少数会持续较长时间。细菌感染： 严重的细菌感染，像败血症，细菌产生的毒素等可能影响血小板的生成和破坏，导致血小板数量降低。
药物因素导致
化疗药物： 一些抗肿瘤的化疗药物在杀伤肿瘤细胞的同时，也会对骨髓造血干细胞产生抑制作用，影响血小板的生成，这是化疗常见的副作用之一。某些抗生素： 比如氯霉素、磺胺类药物等，可能会引起血小板减少。不过这种情况相对较少见，但也需要引起重视，在使用这些药物过程中要监测血小板情况。