怀孕初期孕酮低的原因包括黄体功能不足、甲状腺功能失调以及生理性因素。具体如下：
一、黄体功能不足。当黄体功能出现异常时，会导致孕酮值偏低，甚至在25ng/ml以下。这时需要到医院检查，明确到底是内分泌疾病、胚胎染色体异常还是其他原因引起的，以便进一步采取治疗措施。
1.内分泌疾病可能影响黄体功能，进而导致孕酮低。
2.胚胎染色体异常也可能与孕酮低相关。
二、甲状腺功能失调。若孕妇甲状腺功能失调，体内会出现胰岛素抗体，从而造成孕酮降低。
三、生理性因素。孕酮作为一种释放性激素，在不同时间测量其数值可能会有较大变化。
针对怀孕初期孕酮低的治疗方法有：
一、生活方面。可多吃富含维生素、豆类和果胶类的食物，饮食以清淡为主，多补充叶酸，调节体内分泌。要注意休息，每天坚持适当走动以活动身体，避免性行为，保持心情舒畅，不要过度忧郁。
二、药物治疗。可以服用黄体酮胶囊等药物，或通过肌肉注射来及时补充黄体酮，以调整孕酮过低的状况。如果情况过于严重，需根据医生建议进行保胎治疗，最好卧床休息，避免各类剧烈活动。具体用药应遵循医师嘱托。
总之，怀孕初期孕酮低的原因多样，治疗方法也需根据具体情况选择，同时要注意生活中的各项事项，以保障孕妇和胎儿的健康。