怀孕初期孕酮低的原因主要包括黄体功能不足、甲状腺功能失调以及生理性因素。具体如下：
一、黄体功能不足：当黄体功能出现异常时，孕酮值可能会明显降低，甚至在25ng/ml以下。这时需要前往医院进行详细检查，以明确究竟是内分泌疾病、胚胎染色体异常还是其他原因导致的，然后再进一步采取针对性治疗措施。
二、甲状腺功能失调：若孕妇甲状腺功能失调，体内会产生胰岛素抗体，进而导致孕酮水平降低。
三、生理性因素：由于孕酮是一种释放性激素，所以在不同时间测量其数值可能会有较大变化。
对于怀孕初期孕酮低的治疗方法有以下这些：
1.生活方面：可以多进食富含维生素、豆类和果胶类的食物，饮食尽量以清淡为主，要多补充叶酸，以调节体内分泌。同时要注意休息，每天坚持适当走动，活动身体，避免发生性行为，保持心情舒畅，不要过度忧郁。
2.药物治疗：可服用黄体酮胶囊等药物，或通过肌肉注射的方式及时补充黄体酮，从而改善孕酮过低的情况。如果情况较为严重，则要根据医生建议进行保胎治疗，最好卧床休息，避免各类剧烈活动。具体用药需根据医师嘱托。
总之，怀孕初期孕酮低有多种原因，应根据具体情况采取相应的治疗措施，同时在生活中做好各方面的护理。