药物流产没有流干净可能产生诸多不良影响，比如对子宫内膜造成伤害、引发宫腔感染、引发妇科疾病等。
一、对子宫内膜造成伤害：药物流产若没流干净，残留组织可能会对子宫内膜形成一定损害。残留组织进入宫腔后若无法排出，还有可能植入宫腔。
二、引发宫腔感染：子宫腔内有残留组织会致使阴道出血频繁、出血不规则，进而引发感染甚至导致贫血。
三、引发妇科疾病：若长时间未清理干净，很容易导致病原微生物感染，从而引发子宫内膜炎、盆腔炎等炎症性疾病，同时伴有全身症状，如发烧、疲倦、严重腹痛以及阴道内分泌异常分泌物等。
药物流产没有流干净的治疗方法如下：当药物流产残留小于1厘米时，可在医生指导下口服益母草颗粒、新生化颗粒等药物来促进血液循环、清除血瘀，以帮助子宫恢复正常；若残留超过1厘米，则需要再次清理宫腔，避免残留物长时间存在于宫腔内对身体造成损伤而影响未来妊娠。
总之，药物流产没流干净危害较大，要根据具体情况选择合适的治疗方法。