药物流产流不干净会引发一系列不良现象，主要包括感染和大出血。
一、感染：如果长时间出血，就很可能让患者出现感染症状。因为血液是细菌良好的生存环境，而阴道本身是有菌环境，要是平时不注重卫生，就会导致细菌上行感染，进而使患者出现宫腔粘连，甚至存在不孕的风险。所以患者一定要做好日常的卫生护理工作，以防引发感染。
二、大出血：由于流产不完全，胚胎的残留物可能还留在宫腔内，一旦出现脱落情况，在脱落过程中就极有可能引发大出血，严重情况下会威胁到患者的生命安全。对于流产不干净的患者，要按照医生的指导建议，要么继续使用药物来促使宫腔内的残留物尽快排出体外，要么采取清宫手术进行治疗。
总之，药物流产流不干净危害大，需及时妥善处理以避免严重后果。