手淫后肚子疼可能由多种原因引起，比如肌肉紧张性收缩，一般这种情况可能持续较短时间。
肌肉过度紧张导致
局部肌肉痉挛： 手淫时身体某些部位的肌肉会处于比较紧张的状态，尤其是下腹部的肌肉。如果肌肉持续紧张过度，就可能引发痉挛性疼痛，这种疼痛一般程度不会太严重，可能持续几分钟到几十分钟不等。姿势不当影响： 如果手淫时采取了不太舒适的姿势，长时间保持特定姿势会使腹部肌肉受力不均，也容易引起肚子疼，通常改变姿势休息后可能会有所缓解。
肠道功能紊乱相关
暂时性蠕动异常： 手淫时身体的神经内分泌等调节可能会对肠道产生一定影响，导致肠道蠕动出现暂时性的紊乱。比如肠道蠕动加快或者减慢，就可能引起肚子疼，可能还会伴有轻微的腹胀等表现。刺激引发应激反应： 手淫属于一种较为强烈的刺激行为，可能会引起身体的应激反应，进而影响肠道的正常功能，出现肚子疼的情况，一般应激反应过去后症状会逐渐减轻。
心理因素导致的躯体化表现
精神过度紧张： 部分人可能对手淫存在一些错误的认知，手淫后会产生比较强烈的心理负担，精神处于过度紧张的状态，这种紧张情绪可能会传导到身体上，表现为肚子疼，尤其是本身心理比较敏感的人群更容易出现这种情况。焦虑情绪影响： 长期有焦虑情绪的人，在手淫后可能更容易出现躯体化的症状，肚子疼就是其中一种表现，可能还会伴有心慌、出汗等其他躯体不适。