3个月婴儿鼻塞咳嗽，可能是由以下原因引起的：
1.呼吸道感染：婴儿的呼吸道比较狭窄，容易受到感染。病毒或细菌感染可能导致鼻塞和咳嗽。
2.过敏：婴儿可能对空气中的过敏原过敏，如花粉、尘螨等，引起鼻塞和咳嗽。
3.鼻腔结构问题：婴儿的鼻腔结构可能还没有完全发育好，容易出现鼻塞。
4.环境因素：干燥的空气、烟雾、空气污染等环境因素可能刺激婴儿的呼吸道，导致鼻塞和咳嗽。
5.胃食管反流：婴儿的胃容量较小，容易发生胃食管反流，胃酸反流到喉部可能刺激咳嗽。
针对3个月婴儿鼻塞咳嗽的治疗方法如下：
1.保持空气湿润：使用加湿器增加空气湿度，有助于缓解鼻塞。
2.清理鼻腔：使用生理盐水滴鼻或吸鼻器帮助清理鼻腔分泌物，缓解鼻塞。
3.侧卧睡眠：让婴儿侧卧睡眠，有助于减轻咳嗽。
4.观察症状：密切观察婴儿的症状，如果咳嗽加重、呼吸急促、发热等，应及时就医。
5.就医治疗：如果症状持续或加重，医生可能会建议使用药物治疗，如止咳药、祛痰药等。在使用任何药物之前，请先咨询医生的建议。
需要注意的是，3个月以下的婴儿咳嗽反射较弱，咳嗽可能不明显，但如果出现呼吸急促、呼吸困难等症状，应立即就医。同时，要保持婴儿的清洁卫生，勤洗手，避免接触感染源。如果母亲在哺乳期，应注意饮食清淡，避免食用刺激性食物。