碘131治疗通常用于甲状腺功能亢进症的医治，也可用于甲状腺恶性肿瘤术后的辅助疗法，一般而言是较为安全的，然而若使用过量或身体不适应此药物，就会给身体带来一些损害，这些可能的损害包含：
一、在碘131治疗甲状腺功能亢进症后：
1.少数病人会在一周内出现乏力、食欲减退、恶心等轻微反应，通常在数天内便会消失。
2.服碘13后由于射线对甲状腺组织的破坏，会释放出大量甲状腺激素进入血液，在服碘13后2周左右可能出现甲状腺功能亢进症状加重的情况，个别病人甚至会发生甲状腺危象，其原因可能是在电离辐射作用下甲状腺激素大量释放入血以及精神刺激、感染等所诱发。
二、碘131治疗甲亢最主要的并发症是永久性甲状腺功能低下症，治疗后时间越久，发生率越高，国外每年发病率大概递增2%-3%，我国约为1.0%左右。
三、碘131治疗甲状腺癌转移灶时，因剂量较大可出现如下不良反应：
1.胃肠道反应（恶心和呕吐）。
2.一过性骨髓抑制。
3.放射性唾液腺炎。
4.急性甲状腺危象。
5.治疗后3天左右会发生颈部疼痛和肿胀，吞咽时疼痛，喉部疼痛及咳嗽，使用止痛药后往往难以生效。
6.治疗后2-3个月可能发生头发暂时性脱落等。
总结概括提示：碘131治疗有一定适用范围且一般安全，但不当使用会带来多种不良影响，包括治疗甲亢后的短期轻微反应和可能的危象、导致甲亢的永久性甲状腺功能低下症，以及治疗甲状腺癌转移灶时的多种不良反应。