滤泡性咽炎的治疗药物需根据具体病情选择，常用的有含漱液、含片等。比如复方硼砂含漱液，可清洁口腔、杀菌消炎，一般每天含漱数次。
局部用药缓解症状
含漱液类： 复方氯己定含漱液能有效抑制细菌生长，减轻咽部炎症，每次含漱10 - 15毫升，每天2 - 3次。含片类： 西地碘含片有杀菌、抗感染的作用，含服时慢慢含化，一次1片，一天3 - 5次。
针对病因用药
病毒感染引起： 如果是病毒感染导致的滤泡性咽炎，一般可使用抗病毒口服液辅助治疗，它能在一定程度上抑制病毒复制，但具体效果因个体差异有所不同。细菌感染引起： 若是细菌感染引发，可考虑使用阿莫西林等抗生素，但使用前需确认无过敏史，且必须在医生指导下使用，因为滥用抗生素可能会带来不良后果。
特殊人群用药注意
儿童患者： 儿童使用药物需格外谨慎，含漱液类一般不建议2岁以下儿童使用，含片类要在成人监护下使用，避免误吞等情况。孕妇患者： 孕妇患滤泡性咽炎时，用药更需慎重，含漱液和含片类的选择要咨询医生，因为某些药物可能会对胎儿产生影响，必须在医生评估后选择相对安全的药物。
辅助治疗与药物配合
生活方式配合： 在使用药物治疗滤泡性咽炎的同时，要注意保持良好的生活方式，如多喝水，每天至少饮用1500 - 2000毫升的水，保持咽喉湿润，有助于缓解咽部不适，促进药物更好地发挥作用。避免刺激因素： 要避免吸烟、饮酒以及食用辛辣、刺激性食物，这些因素会加重咽部炎症，影响药物的治疗效果，所以在用药期间一定要严格避免这些不良刺激。