肝胃不和型
常见症状为胃脘胀痛、连及两胁、嗳气后舒适等，可选用气滞胃痛颗粒。该药能疏肝理气、和胃止痛，适用于肝胃不和引起的功能性消化不良。需注意，孕妇慎用，用药期间要保持心情舒畅，避免愤怒、忧郁。
脾胃虚弱型
表现为胃脘隐痛、喜温喜按、神疲乏力等，可选用香砂六君丸。它能益气健脾、和胃，对脾胃虚弱导致的功能性消化不良有改善作用。儿童、年老体弱者应在医师指导下服用，服药时饮食要清淡，忌油腻、生冷食物。
饮食停滞型
主要有胃脘胀满、嗳腐吞酸、厌食等症状，可选用保和丸。其能消食、导滞、和胃，适用于饮食停滞引起的功能性消化不良。小儿服用时需咨询医师或药师，服药期间不宜同时服用滋补性中药。
脾胃湿热型
可见胃脘灼热疼痛、嘈杂、口干口苦等，可选用黄连清胃丸。该药能清胃泻火、润燥通便，对脾胃湿热所致功能性消化不良有一定疗效。阴虚火旺者慎用，服药期间要避免食用辛辣、油腻食物。