美尼尔综合征的发病原因目前尚未完全明确，但有几种常见的相关因素。一般认为，内耳膜迷路积水可能是其主要病理基础，而引发内耳膜迷路积水的因素较多。其中，遗传因素可能起到一定作用，有研究显示约10% - 30%的美尼尔综合征患者有家族史，提示遗传易感性在发病中可能参与。
内耳循环障碍相关
内淋巴产生和吸收失衡： 内淋巴由内耳的血管纹产生，然后通过内淋巴囊等结构吸收。当内淋巴产生过多，或者吸收障碍时，就会导致内耳膜迷路积水。比如，血管纹的毛细血管通透性改变等情况，可能影响内淋巴的正常产生。病毒感染： 有证据表明，某些病毒感染可能与美尼尔综合征的发病有关。例如，腮腺炎病毒、流感病毒等感染后，可能引发内耳的免疫反应，进而影响内耳的正常功能，导致膜迷路积水。
免疫因素相关
自身免疫反应： 人体的免疫系统异常时，可能会攻击内耳的组织。自身免疫性因素被认为与美尼尔综合征的发病有一定关联。当免疫系统错误地将内耳组织当作外来异物进行攻击时，会破坏内耳的正常结构和功能，导致美尼尔综合征相关症状出现。过敏反应： 过敏体质的人接触过敏原后，可能引发内耳的过敏反应，影响内耳的微循环和内环境稳定，从而增加美尼尔综合征的发病风险。比如，对食物、花粉等过敏原过敏的人，在接触过敏原后，可能诱发美尼尔综合征的发作。
内耳解剖因素相关
内淋巴囊功能异常： 内淋巴囊是吸收内淋巴的重要结构，如果内淋巴囊的结构或功能出现异常，就会影响内淋巴的正常吸收，进而导致膜迷路积水。例如，内淋巴囊发育不良或者因某些病变导致其功能受损，都可能与美尼尔综合征的发病相关。膜迷路发育异常： 胚胎发育时期膜迷路发育异常，也可能是美尼尔综合征的发病原因之一。比如，膜迷路的结构在形成过程中出现畸形等情况，使得内耳的正常功能受到影响，容易引发膜迷路积水等问题，从而导致美尼尔综合征的发生。