美尼尔综合征的发病原因目前尚未完全明确，一般认为可能与多种因素有关。目前研究发现，内耳膜迷路积水是美尼尔综合征发病的重要病理基础，而导致内耳膜迷路积水的因素可能涉及以下几方面。
内耳机械性阻塞与内淋巴吸收障碍
膜迷路积水相关：内淋巴管阻塞、内淋巴囊发育不全等情况可能引起内淋巴吸收障碍，从而导致内淋巴积聚，使膜迷路积水。据相关研究，约有10% - 15%的患者存在内淋巴管或内淋巴囊的解剖异常情况。感染因素影响：病毒感染可能是诱因之一，比如腮腺炎病毒、麻疹病毒等感染后，可能引发内耳的免疫反应，影响内耳的正常生理功能，进而增加美尼尔综合征的发病风险。
免疫反应异常
自身免疫因素：有研究表明，部分美尼尔综合征患者存在自身免疫反应异常。体内可能产生针对内耳组织的自身抗体，这些抗体攻击内耳的相关结构，影响内耳的正常功能，导致美尼尔综合征的发生。例如，在一些自身免疫性疾病相关的内耳病中，就发现了类似的免疫异常机制在美尼尔综合征发病中可能起作用。过敏反应关联：过敏体质的人接触过敏原后，可能引发内耳的过敏反应，导致内耳毛细血管扩张，通透性增加，引起膜迷路积水，从而诱发美尼尔综合征。比如对食物、药物、花粉等过敏的人群，相对更易出现这种情况。
遗传因素
家族遗传倾向：美尼尔综合征具有一定的家族遗传倾向。如果家族中有亲属患有美尼尔综合征，那么其他家庭成员患病的风险可能会增加。研究发现，部分美尼尔综合征患者存在特定基因的突变或遗传标记，提示遗传因素在其发病中起到了一定作用。不过，目前已发现的相关遗传基因并非单一的，而是涉及多个基因位点的变化。基因与环境交互：即使有遗传易感性，也并非一定会发病，环境因素也起到重要作用。例如，同样携带相关遗传基因的人，在没有接触到特定环境诱因时，可能不会发病，而一旦接触到如长期压力过大、劳累、头部外伤等环境因素，就可能激发美尼尔综合征的发作。