无痛胃镜一般副作用发生率较低，但也可能存在一些情况。通常来说，无痛胃镜相对安全，但仍有少数人可能出现一些副作用。
麻醉相关副作用
药物过敏风险： 无痛胃镜需要使用麻醉药物，少数人可能对麻醉药物过敏，不过这种情况发生概率较低，大约在万分之几的水平。过敏可能表现为皮疹、呼吸困难等。呼吸抑制风险： 在麻醉过程中，极少数人可能出现呼吸抑制的情况，不过医生会在操作过程中密切监测呼吸等生命体征来避免这种情况发生。一般经验丰富的麻醉医生操作下，这种风险能有效控制。
检查后的不适反应
咽喉不适： 检查后可能会有咽喉部的不适，比如轻微的疼痛、异物感等，通常1 - 2天就会缓解。这是因为检查时胃镜经过咽喉部导致的。头晕乏力： 由于麻醉药物的残留作用，部分人在检查后会有短时间的头晕、乏力感，一般休息几个小时后就能恢复正常。
特殊人群的特殊情况
老年人： 老年人可能本身存在心肺功能等方面的基础疾病，在进行无痛胃镜时需要更谨慎评估。因为麻醉药物可能对心肺功能有一定影响，不过如果在操作前充分评估并做好准备，风险也可控制。比如有冠心病的老年人，要提前告知医生病情，以便医生调整麻醉方案。高血压患者： 高血压患者在检查前需要将血压控制在相对平稳的状态，因为无痛胃镜使用麻醉药物可能会对血压有一定影响，如果血压控制不好，可能增加心脑血管意外的风险。一般建议血压控制在160/100mmHg以下再进行无痛胃镜检查。