做完无痛胃镜后一般副作用较少，多数人不会有明显不适，但少数人可能出现一些情况。通常来说，大部分人的副作用较轻微，持续时间较短。
术后身体可能出现的反应
头晕乏力： 无痛胃镜是通过静脉注射麻醉药物来实现无痛的，部分人在检查后可能会有短时间的头晕、乏力感，一般数小时内可逐渐缓解，通常不会超过24小时。咽喉不适： 检查时胃镜通过咽喉部位，可能会对咽喉黏膜造成一定刺激，导致检查后咽喉有轻微的异物感、疼痛等不适，一般1~2天会自行消失。
药物相关的潜在影响
过敏风险： 虽然发生概率较低，但个别人可能对麻醉药物过敏，轻者可能出现皮肤瘙痒、皮疹等，重者可能出现呼吸困难等严重过敏反应。不过正规医院会在检查前详细询问过敏史，并做好应对过敏的准备。药物代谢影响： 麻醉药物需要通过肝脏、肾脏等器官代谢，对于肝肾功能不全的人来说，可能会在一定程度上加重肝肾的代谢负担，但一般在药物代谢完成后会恢复正常。
检查后的注意事项
饮食方面： 检查后短期内要注意饮食，一般建议2小时后可进食温凉、清淡的流质或半流质食物，如米汤、藕粉等，1天后再恢复正常饮食。避免进食过烫、辛辣、刺激性食物，防止加重咽喉不适或刺激胃肠道。休息方面： 检查后需要休息一段时间，尤其是进行了活检等操作的人，更要注意休息，避免剧烈运动和重体力劳动，让身体有足够时间恢复。如果出现持续不适或症状加重，如剧烈腹痛、持续呕吐、黑便等情况，应及时就医复诊。