通常来说，若小孩发烧是生理性因素导致，那么眼睛疼可能是颅内压引起，属正常现象；若发烧由病毒感染引起，那可能是发烧引发的眼部病变，比如病毒性结膜炎等。患者通常需及时前往医院，明确病因后对症治疗。
一、颅内压增高：人发烧时内部血管会扩张，这种情况下患者颅内压会有一定程度升高，进而导致眼睛疼痛。此症状会随发烧治愈而逐渐消失，通常患者只需治疗发烧即可。
二、病毒性结膜炎：一般而言，如果患者患的是病毒性发烧，可能会累及眼部，致使患者并发病毒性结膜炎。在此种情况下，患者要及时去医院，在医生指导下应用利巴韦林、氧氟沙星等药物进行治疗。
总之，小孩发烧后眼睛疼可能有不同原因，要根据具体情况进行诊断和治疗，以保障孩子的健康。