小腹一阵一阵的疼可能由多种原因引起。比如女性生理期时，部分女性可能会出现小腹一阵一阵的疼，尤其是原发性痛经，疼痛程度因人而异，有的可能较为明显。
妇科方面的原因
月经相关：女性在月经期间，由于子宫内膜前列腺素含量增高，可引起子宫平滑肌过强收缩、血管痉挛，造成子宫缺血、缺氧状态而出现痛经，表现为小腹一阵一阵的疼，有的还可能伴有恶心、呕吐等症状。一般月经来潮时出现，持续2-3天左右。妇科炎症：盆腔炎也可能导致小腹一阵一阵的疼，通常还会伴有白带增多、异味等情况。比如慢性盆腔炎，疼痛程度相对较轻，但会反复出现。
肠道方面的原因
肠痉挛：多因饮食不当引起，比如吃了过多生冷、刺激性食物。肠道平滑肌强烈收缩就会导致小腹一阵一阵的疼，疼痛一般比较突然，可能还会伴有腹泻等表现。肠炎：细菌、病毒感染肠道后引发炎症，也会出现小腹一阵一阵的疼，同时可能伴有腹泻、发热等症状。例如急性肠炎，发病较急，疼痛会较为明显。
泌尿系统方面的原因
输尿管结石：当输尿管内有结石时，结石移动会刺激输尿管平滑肌，引起小腹一阵一阵的疼，这种疼痛往往比较剧烈，还可能伴有血尿、尿频、尿急等症状。疼痛发作时可能难以忍受。