扁桃体发炎时，常用的药物有抗生素类和清热解毒类等。一般细菌感染引起的扁桃体发炎，可选用青霉素类或头孢类抗生素。比如青霉素类中的阿莫西林，对多种细菌有抑制作用。
抗生素类药物
青霉素类： 像阿莫西林，它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥杀菌作用，对敏感菌引发的扁桃体发炎有较好疗效。但要注意，对青霉素过敏者不能使用。头孢类： 常见的有头孢克洛等，同样是通过干扰细菌细胞壁合成来杀菌，不过使用前需确认患者无头孢类药物过敏史。
清热解毒类药物
中成药： 比如蓝芩口服液，具有清热解毒、利咽消肿的功效，能缓解扁桃体发炎引起的咽痛等症状。还有蒲地蓝消炎口服液，也可用于扁桃体发炎的辅助治疗，帮助减轻炎症反应。但这类药物一般作为辅助用药，若病情较重还需配合抗生素使用。
需注意的人群情况
儿童： 儿童扁桃体发炎用药需谨慎，比如阿莫西林，2岁以下儿童使用需严格遵医嘱，因为儿童的肝肾功能发育不完全，药物代谢与成人不同。孕妇： 孕妇患扁桃体发炎时，用药更要格外小心，抗生素的选择需权衡对胎儿的影响，应在医生指导下选择相对安全的药物，清热解毒类药物也要看成分是否适合孕妇使用。
非药物辅助措施
多喝水： 每天保证饮用1500 - 2000毫升的水，有助于保持咽喉部湿润，促进新陈代谢，缓解扁桃体发炎带来的不适。注意休息： 患病期间要保证充足的睡眠，让身体有足够的精力来对抗炎症，一般建议每天睡眠7 - 8小时以上。