巧克力囊肿患者是否能怀孕取决于多种因素，如囊肿大小和疾病严重程度等。患者应及时就医，明确病因并对症治疗。巧克力囊肿即卵巢子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种，可能引发严重盆腔粘连，影响卵巢正常排卵，降低自然受孕几率。
一、若巧克力囊肿较小，仅1至2厘米，且盆腔整体状况良好，不存在水肿、黏连及慢性炎症等不适症状，通常是可以怀孕的。
二、若巧克力囊肿较大，影响了输卵管的排卵功能和卵子收集功能，检查发现盆腔有明显水肿、黏连及慢性炎症等症状，则可能会降低女性怀孕的几率。
对于有生育要求的患者，检查时若巧克力囊肿较大且已导致不孕等不良影响，应在专业医生指导下进行手术治疗。术后要听从医生安排，尽快备孕。
总之，巧克力囊肿患者的怀孕情况较为复杂，需要综合多方面因素来判断，患者应积极配合医生进行诊断和治疗，以提高怀孕的可能性。