青色胎记形成的原因主要与胚胎发育过程中的色素细胞异常有关。胚胎发育时，黑素细胞从神经嵴向表皮移行过程中，部分黑素细胞停留在真皮内，就可能形成青色胎记。
先天性因素导致
胚胎期黑素细胞迁移异常： 在胚胎发育的早期，黑素细胞起源于神经嵴，正常情况下会逐渐迁移到表皮基底层。但如果在迁移过程中，部分黑素细胞没有到达正确位置，而是滞留在了真皮层，就会随着婴儿出生而形成青色胎记。这种情况是先天性的，从胚胎发育阶段就已经奠定了基础。遗传因素的影响： 有研究发现，青色胎记具有一定的遗传倾向。如果家族中有亲属患有青色胎记，那么后代出现青色胎记的概率可能会相对较高。不过，遗传并不是绝对的，只是增加了发病的可能性。
环境因素的潜在影响
孕期环境因素： 母亲在孕期的一些环境因素可能会对胎儿产生影响。比如，孕期接触某些化学物质，像一些工业污染物等，虽然目前并没有确凿的证据表明这些化学物质一定会直接导致胎儿出现青色胎记，但它们可能会干扰胎儿正常的胚胎发育过程，增加胎记形成的风险。另外，孕期受到辐射等不良环境影响，也可能在一定程度上影响黑素细胞的正常迁移，从而促使青色胎记的形成。
其他相关因素
激素水平变化： 在胚胎发育过程中，激素水平的变化也可能与青色胎记的形成有关。黑素细胞的分布和发育可能受到体内激素的调节，当激素水平出现异常波动时，可能会影响黑素细胞的正常行为，导致部分黑素细胞滞留在真皮层，进而形成青色胎记。不过，激素水平变化与青色胎记形成的具体关联机制还在进一步的研究探索中。种族差异相关： 不同种族人群中青色胎记的发生率有所不同。例如，亚洲人相对更容易出现青色胎记，这可能与种族相关的基因等因素有关，但具体的机制还需要更深入的研究来明确。