一觉醒来小腿肌肉酸痛可能由多种原因引起，比如运动因素，若前一天进行了大量运动，尤其是无氧运动，像爬山、深蹲等，24 - 48小时内就可能出现小腿肌肉酸痛，这是因为运动时肌肉产生了乳酸堆积。
运动相关原因
运动强度过大： 当进行超出身体适应范围的运动时，小腿肌肉会过度收缩，代谢产生的乳酸等物质不能及时排出，就会导致酸痛。比如平时很少运动的人突然进行长时间跑步，就容易出现这种情况。运动前热身不足： 运动前没有充分热身，小腿肌肉突然进入紧张的运动状态，也容易引发酸痛。例如直接开始剧烈跳绳而没有做腿部拉伸等热身动作。
疾病相关原因
腰椎间盘突出症： 突出的椎间盘可能压迫支配小腿肌肉的神经，醒来时就可能感觉小腿肌肉酸痛。一般这种情况还可能伴有下肢麻木、腰部疼痛等症状。下肢血管病变： 如下肢静脉曲张、下肢动脉粥样硬化等，会影响小腿肌肉的血液供应，从而导致酸痛。下肢静脉曲张可能会看到腿部有蚯蚓状的血管凸起，下肢动脉粥样硬化患者可能下肢皮肤温度较低。
其他因素
寒冷刺激： 夜间睡眠时小腿暴露在外，受到寒冷刺激，会引起小腿肌肉痉挛性收缩，醒来后就会酸痛。比如空调温度过低，没有盖好被子导致小腿着凉。营养不良： 缺乏钙、维生素D等营养物质时，也可能出现小腿肌肉酸痛。尤其是老年人，钙流失较多，如果饮食中钙摄入不足，就容易发生这种情况。