直肠炎结肠炎的用药需根据具体病情来定。一般来说，常用的药物有氨基水杨酸制剂，像柳氮磺吡啶，它能在肠道内分解出5-氨基水杨酸，起到抗炎作用，不过可能会有恶心、呕吐等副作用。
氨基水杨酸制剂类药物
美沙拉嗪： 有口服制剂也有栓剂、灌肠剂等局部用药形式。口服美沙拉嗪可用于轻中度的直肠炎结肠炎；栓剂和灌肠剂适用于病变局限在直肠部位的患者，局部给药能直接作用于病变部位，起效相对较快，副作用相对口服药可能更小些，但可能会有直肠刺激症状。
糖皮质激素药物
泼尼松： 对于病情较重的直肠炎结肠炎患者，可短期使用糖皮质激素来快速抗炎、减轻水肿等。不过长期使用可能会有较多副作用，比如引起骨质疏松、血糖升高、免疫力下降等，所以一般病情控制后会逐渐减量。氢化可的松： 也可用于病情较重的情况，通常是静脉给药，起效迅速，但同样长期使用有诸多副作用，需要密切监测患者的身体状况。
免疫抑制剂类药物
硫唑嘌呤： 适用于对氨基水杨酸制剂疗效不佳或有激素依赖的直肠炎结肠炎患者。它通过抑制免疫反应来发挥作用，但起效比较慢，一般需要数周甚至数月才能看到效果，而且可能会有骨髓抑制等不良反应，用药期间需要定期监测血常规等指标。巯嘌呤： 作用机制与硫唑嘌呤类似，也用于一些慢性的、病情反复的直肠炎结肠炎患者，使用时同样要注意监测血常规、肝功能等。另外，对于细菌感染引起的直肠炎结肠炎，可能还会用到抗生素，比如氧氟沙星等，但要在明确有细菌感染的情况下，由医生根据药敏试验等结果来合理选用，因为滥用抗生素可能会导致肠道菌群失调等问题。而对于腹泻症状明显的患者，可能会用到止泻药物，如蒙脱石散，它能吸附肠道内的毒素和病菌，起到止泻作用，但如果是感染性腹泻，不能单纯止泻，需要结合抗感染等治疗。同时，患者在用药时要遵循医生的指导，根据自身病情的轻重、个体差异等选择合适的药物，并且要注意药物的不良反应等情况。