新生婴儿消化不良可能出现多种症状。一般来说，新生婴儿消化不良常见的症状有：吐奶频繁，有的婴儿可能一天吐奶次数达2 - 3次甚至更多；大便异常，可能出现大便稀溏、有奶瓣，或者大便干结等情况；还可能伴有腹胀，宝宝肚子看起来鼓鼓的，轻轻触摸能感觉到腹胀。
吐奶方面的表现
吐奶频率较高： 正常新生婴儿可能偶尔吐奶，但消化不良的婴儿吐奶相对频繁，有的一天会吐3 - 5次左右。而且吐出的奶可能带有酸臭味，这是因为消化不好，奶在胃内停留时间较长发酵导致。吐奶量较多： 消化不良时，奶在胃内不能很好地消化排空，所以吐出的奶量可能比正常情况多，有时候会呈喷射状吐出一点。
大便异常的情况
大便稀溏且有奶瓣： 消化不良的婴儿大便往往比较稀，像水一样的稀便，同时能看到明显的奶瓣，这是因为奶没有被充分消化就排出体外了。一般每天大便次数可能在3 - 5次不等。大便干结： 少数消化不良的婴儿也可能出现大便干结的情况，排便困难，大便干硬，有的宝宝可能好几天才排一次大便，排便时会哭闹。
腹胀的具体表现
肚子外观鼓起： 用肉眼观察，消化不良的新生婴儿肚子看起来比正常时更鼓，尤其是在吃奶后或者哭闹后，肚子鼓得更明显。触摸有胀气感： 家长轻轻用手触摸婴儿的肚子，能感觉到肚子比较硬，有胀气的感觉，这是因为胃肠蠕动减慢，气体和未消化的食物积聚在肠道内导致腹胀。