手指甲盖凹凸不平可能是由以下原因引起的：
1.营养不良：指甲是由蛋白质组成的，如果身体缺乏蛋白质、维生素或矿物质等营养物质，指甲就可能出现凹凸不平的情况。这种情况通常还会伴有其他症状，如头发干枯、皮肤干燥等。
2.真菌感染：指甲受到真菌感染时，可能会出现增厚、变形、变色和凹凸不平的情况。这种感染通常会伴有指甲周围的皮肤瘙痒、红肿等症状。如果怀疑是真菌感染，可以使用抗真菌药物进行治疗。
3.银屑病：银屑病是一种慢性炎症性皮肤病，指甲也可能受到影响，出现凹凸不平、凹陷或凸起的情况。此外，银屑病还可能导致指甲周围的皮肤发红、肿胀、疼痛等症状。
4.扁平苔藓：扁平苔藓是一种自身免疫性疾病，指甲也可能受到影响，出现凹凸不平、变薄、易碎等情况。此外，扁平苔藓还可能导致口腔、生殖器等部位的黏膜出现病变。
5.其他原因：指甲盖凹凸不平还可能与外伤、化学物质接触、自身免疫性疾病、内分泌失调等因素有关。
如果发现手指甲盖凹凸不平，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。同时，保持均衡的饮食、避免接触有害物质、注意指甲卫生等也有助于预防指甲问题的发生。