射精时输精管疼可能由输精管炎症、精囊炎、前列腺炎等导致，应及时就医检查以明确病因并对症治疗。
一、输精管炎症：
多由细菌感染引发。其症状通常包括阴囊坠胀疼痛、皮肤红肿及疼痛等。治疗上一般建议在医生指导下用药，如使用阿莫西林胶囊可起到抗菌作用；诺氟沙星胶囊能抑制细菌增殖；对乙酰氨基酚片有助于缓解疼痛等症状。用药需严格遵循医嘱。
二、精囊炎：
通常也是细菌感染引起。往往伴有精液带有红色或褐色、血尿、射精痛、下腹部疼痛等表现。治疗可在医生指导下进行，例如诺氟沙星胶囊、罗红霉素片可抗菌消炎；甲硝唑片能抑制相关病原体。用药务必谨遵医嘱。
三、前列腺炎：
一般是机体抵抗力下降所导致。常见症状有尿频、盆腔疼痛、肢体乏力、尿急等。治疗一般建议在医生指导下用药，像盐酸多西环素肠溶胶囊、左氧氟沙星片等都可用于改善病情。用药必须严格按照医嘱进行。
总之，当出现射精时输精管疼的情况时，要及时就医明确具体病因，然后根据病因进行针对性的治疗，同时要严格按照医生的指导用药，不可自行乱用药物。