结膜炎反复发作的原因主要有两方面。一是患者卫生习惯较差，二是治疗过程中未规范用药导致细菌产生耐药性进而发展为慢性炎症。
一、结膜炎通常是由细菌等感染引起的，结膜富含毛细血管等结构，这为细菌等的繁殖提供了良好条件。当患者感染病原体后，如果不注重个人卫生，即便炎症已得到控制，仍可能出现二次感染。比如患者经常用手揉眼睛，而手又未清洁干净，就容易将细菌等带入眼部，引发再次感染。
二、患者首次感染后若没有进行规范化治疗，会使细菌对所用药物产生耐药性。长期炎症刺激会让机体产生一定适应能力，当细菌毒力较小时，患者可能无明显不适症状；而当细菌毒力较大时，患者就会表现出症状。比如患者没有按照医嘱定时定量使用药物，或者随意停药换药，都可能导致细菌产生耐药性，使得炎症难以彻底消除，反复发作并逐渐转为慢性。
总之，要避免结膜炎反复发作，患者需要养成良好的卫生习惯，并在治疗过程中严格遵循医嘱，规范用药，以促进炎症的彻底治愈。