肛漏主要是由肛周脓肿发展而来，约50%的肛周脓肿若未得到有效治疗，就可能形成肛漏。
肛漏形成的常见原因——肛周感染
肛周脓肿未及时处理： 肛门直肠周围发生感染，形成脓肿，脓肿自行破溃或经切开引流后，创面经久不愈，就容易形成肛漏。比如，肛门腺感染是引发肛周脓肿进而导致肛漏的常见原因，肛门腺开口于肛窦，肛窦易受损伤及细菌感染，从而引起肛腺感染，蔓延形成脓肿，最终形成肛漏。特殊疾病影响： 像克罗恩病、溃疡性结肠炎等肠道疾病，也可能增加肛漏的发生风险。克罗恩病是一种慢性炎性肉芽肿性疾病，可累及胃肠道各部位，当累及肛门直肠时，容易引发肛周病变，进而形成肛漏。
肛漏形成的局部因素——肛门损伤
外伤导致： 肛门部位受到外伤，比如异物损伤、肛门直肠手术等，若处理不当，也可能引发感染形成肛漏。例如，肛门直肠部位进行有创操作时，若消毒不严格或操作不当，就可能引起感染，进而发展为肛漏。肛管直肠结构特点： 肛管直肠周围组织本身的解剖结构特点也与肛漏形成有关。肛管直肠周围间隙较多，细菌容易在这些间隙内滋生蔓延，一旦发生感染，就较易形成肛漏。
肛漏形成的个体因素——免疫力状况
免疫力低下人群： 本身免疫力较差的人，比如患有糖尿病等基础疾病的患者，身体抵抗感染的能力较弱，肛门周围发生感染后，更易发展为肛漏。糖尿病患者由于血糖控制不佳，机体防御功能受到影响，肛周感染后愈合能力下降，容易形成慢性感染灶，进而形成肛漏。卫生习惯不良： 长期不注意肛门局部卫生，肛门周围细菌滋生，也增加了肛周感染的几率，从而可能引发肛漏。比如，不经常清洗肛门、穿着不透气的内裤等，都可能导致肛门周围环境潮湿，利于细菌繁殖，增加感染风险。