滴虫性尿道炎主要通过药物治疗。一般来说，常用的治疗药物是甲硝唑，它可以有效杀灭阴道毛滴虫等病原体。
药物选择要点
甲硝唑： 这是治疗滴虫性尿道炎的常用药物，它能够作用于滴虫的代谢过程，干扰其DNA合成，从而达到杀灭滴虫的目的。不过，孕妇在妊娠前3个月应避免使用甲硝唑，因为可能会对胎儿产生不良影响。
生活方式调整
多饮水： 患者每天应保证充足的饮水量，最好能达到2000毫升以上。多喝水可以增加尿液生成，通过尿液的冲刷作用，有助于将尿道内的滴虫等病原体排出体外，减轻尿道的炎症反应。避免性生活： 在治疗期间，男女双方都应避免性生活。因为滴虫性尿道炎具有传染性，性生活可能会导致交叉感染，使病情反复或加重，影响治疗效果。
性伴侣的处理
性伴侣同时治疗： 由于滴虫性尿道炎可以通过性接触传播，所以患者的性伴侣也需要同时接受检查和治疗。即使性伴侣没有明显的症状，也有可能携带滴虫，若不同时治疗，治愈后的患者很容易再次被性伴侣传染，导致病情复发。