滴虫性尿道炎主要通过药物治疗，通常使用硝基咪唑类药物效果较好，比如甲硝唑，一般采用口服给药的方式。
药物治疗选择
甲硝唑： 是治疗滴虫性尿道炎的常用药物，它能干扰滴虫的DNA合成，从而起到杀灭滴虫的作用。一般成人常用剂量为一次0.2~0.4克，每日3次，连续服用7日左右。替硝唑： 也属于硝基咪唑类药物，对滴虫的作用与甲硝唑类似，疗效较好。替硝唑的服用方法一般是单次口服2克，或者分两次服用，一次1克，连服2日。
治疗中的注意事项
性伴侣同治： 滴虫性尿道炎具有传染性，在治疗期间，患者的性伴侣也需要同时接受检查和治疗，否则容易出现交叉感染，导致病情反复。治疗后复查： 在完成一个疗程的药物治疗后，一般建议在下次月经干净后复查阴道分泌物，连续3次检查结果为阴性，才算临床治愈。因为滴虫可能会在月经前后复发。
特殊人群的治疗考量
孕妇患者： 孕妇患滴虫性尿道炎时，用药需要谨慎。一般建议在妊娠早期（怀孕前3个月）尽量避免使用甲硝唑，可在医生评估后，根据情况选择相对安全的治疗方案，比如局部使用甲硝唑凝胶等，但要严格遵循医生的指导。哺乳期患者： 哺乳期女性使用甲硝唑时，药物可能会通过乳汁传递给婴儿，所以一般不建议哺乳期女性口服甲硝唑，可考虑局部用药，同时要密切观察婴儿是否出现不良反应。
日常护理要点
个人卫生： 患者要保持外阴清洁干燥，每天用温水清洗外阴，勤换内裤，内裤最好用开水烫洗后在阳光下暴晒，以达到杀菌的目的。避免性生活： 在治疗期间应避免性生活，防止病情加重或传染给他人。等到治愈后，恢复性生活时也建议使用安全套，降低再次感染的风险。