多囊卵巢综合征的病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与以下因素有关。目前认为遗传因素在多囊卵巢综合征的发病中占比较重要的地位，据统计，约60% - 70%的患者存在遗传异常。
遗传因素：
家族遗传倾向： 如果家族中有亲属患有多囊卵巢综合征，那么其他成员患病的风险会增加。比如母亲患有多囊卵巢综合征，其女儿患病的几率比正常人群要高很多。研究表明，遗传因素通过影响内分泌调节相关的基因，从而增加了患多囊卵巢综合征的可能性。基因变异： 已发现多个基因与多囊卵巢综合征的发病相关，例如胰岛素受体基因、性激素结合球蛋白基因等的变异，可能会干扰体内激素的正常调节，导致内分泌紊乱，进而引发多囊卵巢综合征。
内分泌失调：
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴调节异常： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）脉冲频率异常，会影响垂体分泌促卵泡生成素（FSH）和促黄体生成素（LH）的比例。正常情况下，FSH与LH的比例较为平衡，但在多囊卵巢综合征患者中，往往出现LH水平升高，FSH水平相对偏低，LH/FSH比值大于2 - 3，这种失衡会影响卵巢的正常排卵功能，导致卵泡发育异常，不能正常排卵。胰岛素抵抗： 约50% - 70%的多囊卵巢综合征患者存在胰岛素抵抗。即身体对胰岛素的敏感性降低，为了维持正常的血糖水平，胰腺会分泌更多的胰岛素，形成高胰岛素血症。高胰岛素血症会刺激卵巢分泌过多的雄激素，导致多毛、痤疮等症状，同时还会进一步干扰排卵，加重多囊卵巢综合征的病情。
生活方式因素：
饮食不均衡： 长期高热量、高脂肪、高糖的饮食，会使身体脂肪堆积，尤其是腹部脂肪堆积。过多的脂肪会影响激素的代谢，导致雌激素水平相对升高，雄激素水平也可能出现异常，从而干扰内分泌系统，增加多囊卵巢综合征的发病风险。例如，长期大量摄入油炸食品、甜食等，就可能对身体的激素平衡产生不良影响。缺乏运动： 缺乏体育锻炼会导致身体代谢减慢，脂肪更容易堆积。同时，运动不足也会影响身体的内分泌调节功能，使得下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能紊乱，增加患多囊卵巢综合征的几率。研究发现，长期久坐、缺乏运动的人群，多囊卵巢综合征的发病率比经常运动的人群要高。