脑瘤的病因目前尚不完全明确，但有一些相关因素被认为可能与脑瘤的发生有关。目前并没有确切的单一因素能完全解释脑瘤的成因，但研究发现以下几方面可能有影响。
遗传因素相关
家族遗传综合征：某些遗传性综合征与脑瘤发生相关，比如神经纤维瘤病Ⅰ型，约5%的患者会发生中枢神经系统肿瘤，患者在儿童期或青春期就可能出现神经系统症状和脑部肿瘤。还有结节性硬化症，也会增加患脑部肿瘤的风险，这类患者常伴有皮肤色素脱失斑、癫痫发作等表现，同时脑部易长肿瘤。
环境因素相关
辐射暴露：长期接受电离辐射是明确的可能导致脑瘤的环境因素。比如在儿童时期因头部疾病接受过多次X射线照射，或者在核辐射事故中暴露于辐射环境下，患脑瘤的几率会明显升高。另外，长期处于含有某些化学污染物的环境中，也可能对脑部细胞产生不良影响，增加脑瘤发生风险，但具体的化学物质种类及作用机制还在进一步研究中。
脑部胚胎发育相关
胚胎残留组织：在胚胎发育过程中，有些原始细胞或组织可能没有完全分化消失，残留在颅内，这些残留组织在一定条件下可能逐渐增殖形成肿瘤。例如颅咽管瘤，就是起源于胚胎期颅咽管的残余上皮细胞。还有脊索瘤，是由胚胎残留的脊索组织发展而来，多发生在颅底部位。
其他潜在因素
病毒感染：有研究表明，某些病毒感染可能与脑瘤的发生有一定关联。比如EB病毒，虽然目前证据还不是非常确凿，但部分研究发现其可能参与了某些脑部肿瘤的发生过程。不过这方面还需要更多深入的研究来明确具体的作用机制和关联程度。