脑瘤的病因目前尚不完全明确，但有一些相关因素可能与之有关。目前并没有一个确切的单一原因能完全解释脑瘤的形成，不过一些常见的相关因素如下：
遗传因素相关
家族遗传综合征： 某些遗传性综合征与脑瘤的发生密切相关。例如，神经纤维瘤病I型患者，大约有10% - 15%的概率会发生中枢神经系统的肿瘤，如视神经胶质瘤等。这种疾病是由基因突变引起的，基因的异常传递使得家族成员有较高的脑瘤发病风险。基因突变： 个体自身的某些基因突变也可能引发脑瘤。比如，视网膜母细胞瘤基因（Rb基因）的突变，除了会导致视网膜母细胞瘤外，还可能与松果体区的肿瘤发生有关。一些抑癌基因的失活或者原癌基因的激活突变，都可能打乱细胞正常的生长调控机制，从而促使脑瘤细胞的形成。
环境因素相关
辐射暴露： 长时间接触电离辐射是一个可能的诱因。例如，在儿童时期接受过头部放疗治疗其他疾病的患者，长大后患脑瘤的风险会增加。日本广岛和长崎原子弹爆炸后的幸存者中，脑瘤的发病率比正常人群有所升高，这与爆炸产生的大量电离辐射有关。化学物质接触： 长期接触某些化学物质也可能增加脑瘤发病几率。比如，长期接触氯乙烯的工人，患脑胶质细胞瘤的风险会明显升高。还有一些农药，如有机氯农药等，虽然具体机制还在研究中，但有研究提示长期接触可能与脑瘤发生存在关联。
其他因素相关
病毒感染： 某些病毒感染可能与脑瘤发生有一定关系。例如，EB病毒感染与中枢神经系统的淋巴瘤有一定相关性。不过，病毒感染导致脑瘤的具体机制较为复杂，可能是通过影响细胞的DNA合成、细胞增殖调控等多个环节来发挥作用。免疫功能异常： 当人体免疫功能出现异常时，免疫系统对体内异常细胞的监视和清除能力下降，也可能增加脑瘤发生的机会。例如，艾滋病患者由于免疫系统严重受损，发生中枢神经系统淋巴瘤等脑瘤的概率比正常人要高很多。