肛门乳头瘤常见的症状有排便不适，比如排便时可感觉到肛门内有肿物脱出，刚开始肿物较小，排便后可自行缩回，随着病情发展，肿物脱出后需用手推回甚至无法回纳。另外，还可能出现肛门瘙痒，由于乳头瘤脱出后，会有少量黏液流出，刺激肛门周围皮肤，引起瘙痒不适。还有部分患者会有肛门疼痛，当乳头瘤发生炎症或者受到摩擦时，就会出现疼痛，尤其是排便时疼痛可能会加重。
肿物脱出表现
初期情况： 肛门乳头瘤初期较小，排便时偶有较小的乳头瘤脱出肛门外，一般脱出物直径多在0.5~1厘米左右，排便后可自行缩回。进展情况： 随着病情进展，乳头瘤逐渐增大，脱出物直径可能会达到1~2厘米甚至更大，脱出后需用手推回肛门内，严重时在行走、咳嗽等腹压增加的情况下也会脱出。
肛门瘙痒特点
黏液刺激： 肛门乳头瘤患者由于瘤体刺激，会分泌少量黏液，这些黏液可流到肛门周围皮肤，长期刺激就会引起肛门瘙痒，瘙痒程度因人而异，有的患者是轻微瘙痒，有的则比较严重，会忍不住搔抓。皮肤影响： 长期瘙痒搔抓可能会导致肛门周围皮肤出现抓痕、破溃等情况，进一步加重不适。
肛门疼痛情况
炎症刺激： 当肛门乳头瘤发生炎症时，会出现疼痛，这种疼痛多为胀痛，疼痛程度一般在轻度到中度之间。比如乳头瘤受到细菌感染引发炎症，就会有疼痛感觉。排便时加重： 在排便过程中，粪便通过肛门时会刺激到乳头瘤，导致疼痛加剧，有的患者排便后疼痛还会持续一段时间，影响正常的排便体验。