治胃食管反流常用的药物有质子泵抑制剂、H₂受体拮抗剂等，其中质子泵抑制剂效果较好，比如艾司奥美拉唑，一般规范用药后能在数小时内缓解症状。
质子泵抑制剂类药物
作用机制：这类药物能抑制胃壁细胞上的质子泵，从而减少胃酸分泌。像艾司奥美拉唑，它可以特异性地作用于胃黏膜壁细胞，有效抑制基础胃酸分泌和刺激引起的胃酸分泌。适用情况：适用于症状较重的胃食管反流患者，能快速缓解烧心、反酸等症状。但要注意，孕妇及哺乳期妇女使用需谨慎，儿童用药也需在医生指导下进行。
H₂受体拮抗剂类药物
西咪替丁：通过竞争性拮抗组胺H₂受体，减少胃酸分泌。不过它的抑酸作用相对质子泵抑制剂较弱，一般用于轻至中度胃食管反流患者。雷尼替丁：同样是H₂受体拮抗剂，能有效抑制基础胃酸及由食物和组胺等引起的胃酸分泌。但有严重肝肾功能不全的患者要慎用，使用时需监测肝肾功能。
促胃肠动力药
多潘立酮：可以促进胃肠道蠕动，加快胃排空，从而减少胃内容物反流。成人常用，但婴幼儿使用需特别谨慎，6岁以下儿童使用要严格遵循医生指导。莫沙必利：也是促胃肠动力药，能促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道蠕动，改善胃食管反流引起的不适症状。不过，存在心脏疾病的患者使用时要注意药物对心脏的影响，需在医生评估后使用。