食管反流可以使用抑酸药等药物来缓解症状，比如质子泵抑制剂中的奥美拉唑等，一般能较快改善不适。通常规范用药后能在数小时到数天内减轻反流相关症状。
抑酸药物类
质子泵抑制剂：这类药物能有效抑制胃酸分泌，像奥美拉唑，它通过特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的最后步骤，从而减少胃酸对食管黏膜的刺激。一般来说，口服后1 - 2小时起效，可在一定程度上快速缓解食管反流引起的烧心、反酸等症状。H₂受体拮抗剂：例如雷尼替丁，它能竞争性阻断组胺H₂受体，减少胃酸分泌。其作用相对质子泵抑制剂稍弱，但也能对食管反流起到一定的缓解作用，服药后大约1 - 3小时发挥作用。
促胃肠动力药物类
多潘立酮：它可以促进胃肠蠕动，增加食管下括约肌张力，加速胃排空，从而减少胃内容物反流至食管。一般在饭前15 - 30分钟服用，能帮助改善食管反流导致的消化不良等情况，通常服用后0.5小时左右开始起效。莫沙必利：同样是促胃肠动力药，它能促进乙酰胆碱的释放，增强胃肠道蠕动，改善食管蠕动功能和胃排空，进而减轻食管反流症状，服用后大约0.5 - 1小时起效。
黏膜保护剂类
铝碳酸镁：它可以中和胃酸，还能在食管、胃黏膜表面形成保护屏障，防止胃酸、胆汁等对黏膜的损伤。服用后能快速发挥作用，一般嚼服后几分钟到半小时内就能缓解烧心、胃痛等食管反流相关不适。硫糖铝：它在酸性环境下可解离出硫酸蔗糖复合离子，能与溃疡或炎症处的蛋白质结合形成保护膜，保护食管和胃黏膜免受反流物的刺激，服用后约1 - 2小时在局部发挥作用。