女性尿道炎主要是由细菌等病原体感染引起的，大约50%的女性在一生中会遭遇至少一次尿道炎。
病原体感染途径
上行感染： 这是最常见的途径，细菌（如大肠埃希菌等）由尿道外口进入尿道，然后沿着尿道向上蔓延至膀胱、输尿管甚至肾脏。比如女性尿道短而直，长度约3 - 5厘米，这就使得细菌更容易入侵。性生活时，容易将外阴及阴道内的细菌挤入尿道，从而引发感染。血行感染： 较少见，细菌从身体其他部位的感染灶，通过血液循环到达尿道引起感染。例如患有皮肤感染、扁桃体炎等疾病时，细菌可通过血液传播到尿道。
局部因素影响
尿道局部情况： 尿道有结石、异物、憩室等情况时，会破坏尿道黏膜的防御机制，有利于细菌滋生繁殖。比如尿道结石会阻碍尿液正常排出，尿液残留容易成为细菌生长的温床。另外，尿道处女膜融合等解剖结构异常，也会影响尿液的正常排出和局部的清洁，增加尿道炎的发生风险。阴道分泌物影响： 女性阴道分泌物较多时，如果不注意局部清洁，分泌物中的细菌可能会污染尿道。比如患有阴道炎时，阴道内的细菌容易蔓延至尿道，引发尿道炎。
机体抵抗力下降
免疫力低下时： 当女性身体抵抗力下降，如患有糖尿病、长期使用免疫抑制剂等情况时，身体对细菌的抵御能力减弱，尿道更容易受到细菌侵袭而发生感染。例如糖尿病患者由于血糖较高，有利于细菌生长繁殖，同时自身免疫功能也会受到影响，比常人更易患尿道炎。