甲状腺功能性减退症是由于甲状腺激素合成及分泌减少，或其生理效应不足所致机体代谢降低的一种疾病。可以通过以下方法治疗：
1.药物治疗：
左甲状腺素钠片：适用于先天性甲状腺功能减退症与儿童及成人的各种原因引起的甲状腺功能减退症的长期替代治疗，也可用于单纯性甲状腺肿，慢性淋巴性甲状腺炎，甲状腺癌手术后的抑制（及替代）治疗，也可用于诊断甲状腺功能亢进的抑制试验。
甲状腺片：主要用于各种原因引起的甲状腺功能减退症。
2.饮食治疗：
补充适量碘：忌用生甲状腺肿物质。
供给足够的蛋白质：每人每天蛋白质量至少超过20g，才能维持人体蛋白质平衡蛋，氨基酸是组成蛋白质的基本成分，每日约有3%蛋白质不断更新，甲减时小肠黏膜更新速度减慢，消化液分泌腺体受影响，酶活力下降，一般白蛋白下降，故应补充必需氨基酸，供给足量蛋白质，改善病情。
限制脂肪和富含胆固醇的饮食：甲减病人往往有高脂血症，这在原发性甲减更明显，故应限制脂肪饮食。每日脂肪供给占总热量20%左右，并限制富含胆固醇的饮食。
3.病因治疗：
呆小病：病因治疗是呆小病的特效疗法。应从小剂量开始，以使TSH下降至正常水平为宜。
黏液性水肿昏迷：迅速补充甲状腺激素、静脉注射L-T3，清醒后改为口服。无注射剂时，可给予T4片鼻饲，清醒后立即改为口服。有感染者，应积极控制感染。