抗磷脂抗体综合征的症状多样，患者可能出现血栓形成相关症状，比如动脉血栓，约20%的患者会发生脑动脉血栓，导致头痛、偏瘫等；静脉血栓也较常见，像深静脉血栓，可表现为肢体肿胀、疼痛等。
血管相关症状
动脉血栓表现： 除了脑动脉血栓，还可能出现冠状动脉血栓，引发胸痛等类似冠心病的症状；也可能有视网膜动脉血栓，导致视力下降甚至失明。静脉血栓表现： 除了深静脉血栓，还可能出现肝静脉血栓，引起肝肿大、腹痛等；肾静脉血栓则会出现血尿、蛋白尿等。
妊娠相关症状
反复流产： 多数患者会出现反复自然流产，一般发生在妊娠中晚期，这是抗磷脂抗体综合征比较典型的妊娠表现之一，大约50% - 90%的患者会有这种情况。胎儿生长受限： 还可能出现胎儿生长缓慢，导致胎儿体重低于同孕周正常胎儿，影响胎儿的正常发育。
皮肤相关症状
网状青斑： 约30% - 50%的患者会出现网状青斑，表现为皮肤上出现蓝紫色网状或斑点状的花纹，尤其在寒冷环境下更为明显。血小板减少相关皮肤表现： 由于血小板减少，可能会出现皮肤瘀点、瘀斑等，比如下肢容易出现针尖大小的出血点。