补牙三年后疼，可能是以下原因引起：
1.龋齿：补牙后，口腔卫生不佳或细菌感染可能导致龋齿再次发生，引起牙疼。
2.牙髓炎或根尖周炎：补牙时如果牙髓受到感染，或补牙后牙髓炎或根尖周炎未得到及时治疗，可能导致牙疼。
3.牙齿裂：补牙后牙齿可能受到外力撞击或咀嚼硬物，导致牙齿裂，进而引起牙疼。
4.牙龈问题：牙龈炎、牙周炎等牙龈疾病也可能导致牙疼。
5.其他问题：如牙根吸收、补牙材料松动或脱落等。
针对补牙三年后疼的情况，建议采取以下措施：
1.就医检查：及时就诊口腔科，医生会进行详细的口腔检查和诊断，确定牙疼的原因。
2.治疗方法：根据病因，医生可能会采取以下治疗措施：
龋齿：可能需要进行根管治疗或拔牙。
牙髓炎或根尖周炎：需要进行根管治疗。
牙齿裂：可能需要进行修复或拔牙。
牙龈问题：需要进行洁牙、刮治等治疗。
其他问题：根据具体情况进行相应的处理。
3.口腔护理：保持良好的口腔卫生，每天刷牙两次，使用牙线和漱口水，定期洗牙。
4.避免诱因：避免咀嚼硬物，避免吃过冷、过热或辛辣食物，减少对牙齿的刺激。
需要注意的是，每个人的情况可能不同，治疗方案应根据具体情况制定。在治疗过程中，应遵循医生的建议，积极配合治疗，并定期复诊。如果牙疼严重或持续不缓解，应及时就医。此外，如果补牙时使用的是银汞合金材料，补牙三年后可能会出现汞合金释放的问题，导致牙龈黑线等问题。如果出现这种情况，也应及时就医咨询。