男的上小便的时候痛可能是尿道炎、尿道结石、膀胱炎等原因所致。
一、尿道炎：尿道炎的出现主要与细菌感染有密切关系，像金黄色葡萄球菌和绿脓杆菌等。当尿液中滋生较多细菌时，就会对尿道部位形成刺激，从而导致在排小便时出现疼痛现象。比如，这些细菌会侵袭尿道黏膜，引发炎症反应，进而产生尿痛感。
二、尿道结石：男性若患有尿道结石，在排尿过程中结石位置可能会移动，进而划伤尿道上皮，这就会造成小便疼痛的情况，同时还有可能引发血尿。因为结石在移动过程中会对尿道壁造成摩擦和损伤。
三、膀胱炎：膀胱炎往往由细菌感染引起，此时在排尿时容易出现疼痛，还可能伴有排尿烧灼感。这是由于膀胱炎症刺激导致膀胱敏感性增高。
此外，小便疼痛还可能与尿道损伤、尿道异物、肾盂肾炎等因素有关，所以需要进行进一步的检查和相应治疗，以明确具体原因并采取合适的措施来解决。总之，男性小便时疼痛不可忽视，应及时就医排查各种可能原因，以便对症治疗。