咽喉囊肿的病因尚不完全明确，可能与以下因素有关。
1.喉部反复感染：喉部长期受到炎症刺激，可能导致黏膜下腺体阻塞，分泌物潴留，从而形成囊肿。
2.喉先天性畸形：喉发育异常可导致喉结构薄弱，黏膜下组织容易发生黏液潴留，形成囊肿。
3.内分泌因素：女性在青春期、妊娠期或绝经期，体内激素水平变化可能会影响喉部组织的代谢，增加囊肿的发生风险。
4.机械刺激：长期吸烟、饮酒、过度用嗓等，可能导致喉部黏膜受损，增加囊肿形成的几率。
5.其他因素：喉部外伤、异物刺激、过敏反应等也可能导致喉部组织损伤，进而引发囊肿。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况因人而异。如果出现咽喉部不适、异物感等症状，应及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。