小便时尿道疼痛，结束时尿道口疼痛，可能与以下原因有关：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，可由细菌、支原体、衣原体等感染引起。患者除了尿痛，还可能出现尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，患者应注意多饮水，以增加尿量，冲刷尿道，促进恢复。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也可由细菌感染引起。除了尿痛，患者还可能有尿频、尿急、下腹部疼痛等症状。治疗膀胱炎主要是使用抗生素，如头孢呋辛酯、磺胺嘧啶等。此外，患者也需多饮水，注意休息。
3.前列腺炎：前列腺炎是前列腺的炎症，可分为急性和慢性两种。患者可出现尿频、尿急、尿痛、尿道口疼痛、尿不尽等症状。急性前列腺炎需要使用抗生素治疗，如头孢噻肟钠、左氧氟沙星等。慢性前列腺炎的治疗较为复杂，除了使用抗生素，还可能需要使用α受体阻滞剂、非甾体抗炎镇痛药等。
4.尿道结石：尿道结石可导致排尿不畅，尿液刺激结石周围的黏膜，引起疼痛。患者还可能出现排尿困难、血尿等症状。尿道结石的治疗方法主要包括保守治疗和手术治疗，具体治疗方法需根据结石的大小、位置等因素决定。
5.其他：尿道口局部的损伤、尿道口息肉、尿道口囊肿等也可能导致尿痛。
如果出现小便时尿道疼痛，结束时尿道口疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，患者在治疗期间应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免食用辛辣刺激性食物，多饮水，多排尿，有助于病情的恢复。