小便快结束时尿道疼痛可能是以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，常由细菌感染引起。除了尿道疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，要注意多喝水，促进排尿，有助于缓解症状。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱黏膜的炎症，也常由细菌感染引起。除了尿道疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、下腹疼痛等症状。治疗膀胱炎的方法与尿道炎类似，也是使用抗生素。此外，还可以使用一些缓解症状的药物，如布洛芬等。
3.前列腺炎：前列腺炎是前列腺的炎症，常见于男性。除了尿道疼痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、会阴部疼痛、性功能障碍等症状。治疗前列腺炎需要根据具体情况选择合适的方法，如使用抗生素、α受体阻滞剂、物理治疗等。此外，还需要注意生活习惯的调整，如避免久坐、少吃辛辣食物、戒烟戒酒等。
4.尿道结石：尿道结石是尿道内的结石，可导致尿道狭窄和疼痛。除了尿道疼痛，还可能伴有排尿困难、血尿等症状。较小的结石可以通过多喝水、服用排石药物等方法排出体外；较大的结石则需要通过手术或其他方法取出。
5.其他原因：除了上述疾病，其他原因如尿道损伤、尿道狭窄、尿道口息肉等也可能导致小便快结束时尿道疼痛。
如果出现小便快结束时尿道疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。