毛囊炎的治疗药物需根据病情等因素选择，一般细菌感染引起的毛囊炎，可使用抗生素类药物。比如对于轻度的细菌感染性毛囊炎，外用莫匹罗星软膏等可能有效，而中重度的可能需要配合口服抗生素，像头孢类抗生素等，但具体用药要遵医嘱。一般来说，经过规范用药，多数毛囊炎能得到控制。
细菌感染性毛囊炎常用药
外用抗生素： 比如莫匹罗星软膏，它能抑制细菌生长，适用于局部轻度的毛囊炎，直接涂抹在患处即可。还有夫西地酸乳膏，对引起毛囊炎的常见细菌有较好的抑制作用，涂抹后能帮助减轻炎症。口服抗生素： 如果毛囊炎比较严重，范围较大或者反复发作，可能需要口服抗生素。像头孢呋辛酯，它属于头孢类抗生素，能对抗多种细菌。不过使用口服抗生素时要注意，必须在医生指导下使用，不能自行滥用。
真菌感染性毛囊炎用药
外用抗真菌药： 像酮康唑乳膏，它可以抑制真菌的生长繁殖，对于由真菌感染引起的毛囊炎有一定疗效。使用时要均匀涂抹在受感染的部位。还有联苯苄唑喷雾，方便用于身体较大面积的真菌感染性毛囊炎。口服抗真菌药： 若真菌感染性毛囊炎比较顽固，可能需要口服抗真菌药物，例如伊曲康唑。但口服抗真菌药有一定的副作用和禁忌证，必须在医生评估后使用，比如要考虑患者的肝肾功能等情况。
特殊人群用药注意
儿童患者： 儿童得了毛囊炎用药要特别谨慎。如果是儿童的轻度细菌感染性毛囊炎，外用药物选择要更温和，像一些儿童专用的抗生素软膏。而口服抗生素更要严格遵医嘱，因为儿童的肝肾功能还未发育完全，药物代谢与成人不同。对于儿童的真菌感染性毛囊炎，外用抗真菌药相对安全些，但口服抗真菌药一般不轻易使用，必须在医生指导下权衡利弊。孕妇患者： 孕妇患毛囊炎用药需格外小心。如果是细菌感染性毛囊炎，外用药物选择要尽量选择对胎儿影响小的，比如一些比较安全的外用抗生素软膏。如果考虑口服抗生素，必须由医生评估孕妇的病情和胎儿情况后，谨慎选择对胎儿影响最小的药物。对于真菌感染性毛囊炎，外用抗真菌药相对安全，但口服抗真菌药一般禁用，以免影响胎儿发育。