胎记的形成原因目前尚不十分明确，但有几种常见因素容易引发。一般认为，胎记的形成可能与胚胎发育过程中的异常有关，其中血管型胎记的形成与血管发育异常密切相关，而色素型胎记则多与色素细胞的聚集等因素有关。
遗传因素相关
家族遗传倾向： 部分胎记具有一定的遗传易感性。如果家族中有亲属患有胎记，那么后代出现胎记的概率可能会相对较高。例如，某些遗传性的色素型胎记，可能会在有家族史的人群中更易出现。基因变异影响： 基因的变异可能会干扰胚胎发育过程中皮肤组织的正常分化和发育，从而导致胎记的形成。虽然具体哪些基因变异会直接导致胎记还在进一步研究中，但基因层面的异常是胎记形成的一个潜在因素。
胚胎发育时期的因素
血管发育异常： 在胚胎发育的早期，血管系统的形成过程中出现异常，就可能引发血管型胎记。比如鲜红斑痣，就是由于胚胎时期血管发育畸形，导致真皮浅层毛细血管扩张所致。在胚胎发育的第4 - 8周，血管系统开始初步构建，此时任何干扰这个过程的因素都可能导致血管发育异常进而形成胎记。色素细胞聚集： 对于色素型胎记，像太田痣，是在胚胎发育时，黑素细胞从神经嵴向表皮移行期间，由于某种原因未能通过表皮、真皮交界，停留在真皮内而形成的。在胚胎发育的特定阶段，色素细胞的迁移出现异常，就会使得色素在局部聚集，最终形成胎记。
孕期母体的状况影响
孕期受到辐射： 如果孕妇在孕期接触了过量的辐射，比如在放射科工作且防护不当，或者长期处于有辐射的环境中，可能会影响胚胎的正常发育，增加胎儿出现胎记的风险。一般来说，孕妇应尽量避免接触高强度的辐射源，如超过安全剂量的医疗辐射等。孕期用药不当： 孕妇在孕期如果服用了某些不当的药物，也可能对胎儿的发育产生影响，进而导致胎记形成。虽然大多数药物在正常使用下是安全的，但一些具有致畸性或影响胚胎发育的药物，如果孕妇在不知情的情况下服用，就可能干扰胎儿皮肤组织的正常发育，增加胎记发生的可能性。不过，孕妇用药必须在医生的严格指导下进行，不能自行随意用药。