十三岁女孩三个月没来月经可能正常也可能异常。正常情况是发育未成熟导致月经周期不规律；异常情况包括子宫内膜增厚、子宫发育偏小等。具体如下：
一、正常情况：十三岁女孩的发育尚未完全成熟，下丘脑-垂体-卵巢生理轴的功能不完善，进而使得月经不规律，主要表现为月经周期紊乱、月经量时多时少等，这属于正常现象，无需过度焦虑。通常在经过两到三年后，月经会逐渐趋向规律。
二、异常情况：
1.子宫内膜增厚：十三岁女孩处于发育阶段，体内激素水平不稳定，或者长期摄入外源性雌激素，都可能引起子宫内膜增厚，这通常会对月经时间产生影响，比如导致三个月没来月经。需要依据医嘱服用性激素类药物进行治疗，同时要控制体重。日常应多吃新鲜蔬菜水果，减少辛辣刺激、油腻以及高脂肪食物的摄入。
2.子宫发育偏小：十三岁女孩三个月没来月经可能与子宫发育偏小有关。在发育期如果营养不足以及雌激素缺乏，会影响子宫的发育情况，而子宫发育偏小会致使月经不规律，需要关注内膜状况。如果内膜情况较好则不必过于担忧，同时应尽量多食用富含营养物质的食物来调理身体，也可以就医检查六项性激素，再根据医嘱使用八珍益母胶囊、益母草胶囊等药物进行调理。
总结：十三岁女孩三个月没来月经要根据具体情况判断，若是正常发育因素可先观察，若是病理因素则要及时就医并对症处理。